問題タブ [seurat]
For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.
r - 単一細胞 RNA 配列データの異なる遺伝子発現における 2 つの共変量をどのように説明するのですか?
私はさまざまな年齢と性別の人間のデータを持っています。との統合を使用した後seurat、遺伝子発現差解析中にこれらの交絡因子をどのように制御するのが最善でしょうか。関数に潜在.varsのオプションが表示されFindMarkersます。latent.vars = c("Age", "gender")両方を一緒に説明することはできますか？または、一度に 1 つしか使用できませんか?
テストをより適切に行うための代替パッケージはありますか? 前もって感謝します！
r - forループ中にRでSeuratオブジェクト名を取得する
私は Seurat で単一セル rna-seq に取り組んでおり、Seurat オブジェクトに対して for() ループを作成して、平均遺伝子発現のヒートマップをいくつか描画しようとしています。
i を seurat オブジェクトとして使用するため、ggsave 行は機能しません。したがって、私の質問: "i" に格納されている私の seurat オブジェクトの名前を使用するように ggsave() を取得するにはどうすればよいですか?
私はsubstitute(i)とdeparse(substitute(i))を試しましたが成功しませんでした。