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snakemake - snakemake の顧客ラッパーでワイルドカードにアクセスする方法
私は、snakemake のクラスターにジョブを送信するためのラッパーを持っています。次の方法でジョブのプロパティを取得できます
しかし、もしあれば、各ルールでワイルドカードにアクセスする方法は?
ありがとう!トミー
python - 遺伝子座タグ ID に基づいてシーケンスを取得する - SnakeMake
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私は、バイオインフォマティクスの目的で、snakemake のワークフローに取り組んできました。私が今持っているファイルは、さまざまな遺伝子座タグを含むテキスト ファイルです。これらの遺伝子座タグからシーケンスを取得する必要があります。私はsnakemakeのドキュメントを研究してきましたが、遺伝子座タグと生物に基づいてシーケンスを取得するためのlibaryの正しい機能をまだ見つけることができません...私が今持っているコード:
output.txt の出力