問題タブ [snakemake]

For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.

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snakemake - snakemake の顧客ラッパーでワイルドカードにアクセスする方法

私は、snakemake のクラスターにジョブを送信するためのラッパーを持っています。次の方法でジョブのプロパティを取得できます

しかし、もしあれば、各ルールでワイルドカードにアクセスする方法は?

ありがとう!トミー

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python - 遺伝子座タグ ID に基づいてシーケンスを取得する - SnakeMake

この種のプログラミングに関する質問が StackOverflow ガイドライン内で許可されることを願っています。そうでない場合は、間違っている場合は修正してください。

私は、バイオインフォマティクスの目的で、snakemake のワークフローに取り組んできました。私が今持っているファイルは、さまざまな遺伝子座タグを含むテキスト ファイルです。これらの遺伝子座タグからシーケンスを取得する必要があります。私はsnakemakeのドキュメントを研究してきましたが、遺伝子座タグと生物に基づいてシーケンスを取得するためのlibaryの正しい機能をまだ見つけることができません...私が今持っているコード:

output.txt の出力