問題タブ [pheatmap]

Rで次のタイプの不連続ヒートマップに似たものを作成したいと思います:

私のデータは次のように配置されています。

k_ex 軸、percenty 軸になりtime、色を示したいと思います。

私が見つけることができるすべてのリンクは、連続行列 http://www.r-bloggers.com/ggheat-a-ggplot2-style-heatmap-function/または補間をプロットしました。しかし、私は上記のどちらも望んでいません。上の画像のように不連続なヒートマップをプロットしたいと思います。

存在するすべての答えがうまくいきません！これらの質問はヒート マップを並べて作成し
、同じ pdf に 2 つのヒートマップを R に並べて表示するか、ggplot2 などを使用して並べてプロットします。

df1 の上位 10 行 (平均に基づく) と下位 10 行 (平均に基づく) をプロットしたい 2 つの dfs があります。 df1は前回の投稿から、df2は以下の通りです。

df1 から、前の投稿で、0.02 よりも高いもののヒートマップをプロットします (10 個だけとしましょう)。df2 から、しきい値が 0.0 よりも低いもののヒートマップをプロットしますが、両方の画像を 1 つの図にまとめます。

df1 と df2 をプロットするために私がすることは次のとおりです

上記のリンクから取得できるdf1の場合、次のようにできます

df2 をプロットするには、次のようにします

私が望むのは、両方のヒートマップを1つの画像にプロットすることです(df1の一部とdf2の他の部分)

「pheatmap」パッケージを使用してヒートマップを描画し、行と列でクラスタ化します。ただし、何らかの理由で、ヒートマップで行の順序と列の順序を取得する必要があります。それを行う便利な方法はありますか？これは pheatmap の例です。

Rのpheatmapによって作成されたヒートマップに行注釈を追加しようとしています。基本的に、ヒートマップの行注釈に使用される特定の列(グループ)を含むcsvファイルがあります。ただし、次のコードに問題があります。他の 2 つの問題は、タイトルのフォント サイズが大きすぎるようですが、小さくする方法が見つかりませんでした。そして、ゼロの値を純粋な白に設定したかったのですが、出力ファイルで本当に白かどうかはわかりません。入力 csv ファイルと出力 pdf ファイルがリンクされています。他のヒートマップ関数よりも自分のニーズに合ったヒートマップを作成することがわかったので、ここでは pheatmap を使い続けています。提案を歓迎します。

このヒートマップで、カラー スケールの 0 ポイントを白に設定するにはどうすればよいですか? breaksパラメータを使用していますか？

次のコードでは、白が 3 (またはスケール上でそれに近い値) に設定されています。

自分の行と列の名前を編集したい、pheatmapまたは最終的に削除して、編集する新しい行と列の名前を追加したい。この場合、 と を設定し show_colnamesます。show_rownamesFALSE

誰か助けてくれませんか。

2列のデータフレームがあります。ここで、最初の列にはデータが d/m/yh:m (1 年間) として保持され、2 番目の列には電気メーターの読み取り値が保持されます。例えば：

毎日30分ごとにヒートマップを描きたいです。を試しましpheatmapたがheatmap.2、heatmap.3エラー メッセージはx' must be a numeric matrixです。これらの 2 つの列を使用してマップを描画できるか、または最初にデータを次のような 1 日のデータを示す 1 つの行に配置する必要があるかどうか疑問に思っています。

何か提案はありますか？ありがとうございました！

まあ言ってみれば：

色の定義:

私は pheatmap 関数でクラスタリングせずにヒートマップを作成しています:

問題は、同じヒートマップを取得するために色を定義する方法ですが、特定の値のピクセル (たとえば、0.1 未満) のみを使用して色を定義する方法です。

セットしてみた

しかし、うまくいきませんでした。