問題タブ [dendextend]

For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.

0 投票する
2 に答える
1416 参照

r - dendextend を使用して R でタングルグラム サブプロットをプロットする

dendextendを使用して R でタングルグラムをプロットしています。を使用して複数のサブプロットをプロットできるかどうか疑問に思っていpar(mfrow = c(2,2))ますか?

私はそれを理解できないようです。

ありがとう

0 投票する
2 に答える
3746 参照

r - Corrplot によるデンドログラム (R)

Rcorrplot相関プロットを樹形図で装飾する方法はありますか?

0 投票する
1 に答える
1916 参照

r - rでデンドログラムをカットする方法

わかりましたので、これは以前に尋ねられたと確信していますが、何時間も検索した後、どこにも良い答えが見つかりません.

いくつかのデータがあり、分類を実行してから樹形図を作成します。

問題は、特に美学に関係しています。(1) グループの数に応じてカットする方法 (この例では 3 つが必要です)、(2) グループ ラベルを木の枝に揃える、(2) 巨大にならないように再スケーリングするグループ間のギャップ

(3) の詳細。私は非常に種が豊富なデータセットを持っており、切断せずに約1000のグループがあります。たとえば 3 で切断すると、木の右側にいくつかの枝があり、右側に 1 マイル離れたところに枝があり、より近くなるように再スケーリングする必要があります。これはすべて外部プログラムを介して可能ですが、rですべてやりたいです!

  1. このプロットの右上にネストされた平均シルエット幅プロットを配置できる場合のボーナス ポイント

これは虹彩データを使用した例です

0 投票する
2 に答える
91 参照

r - 指定された深さのカットオフの枝の下に葉の名前を取得する

dendrogram特定の深さのカットオフに対して、その深さのカットオフより下の枝ごとに、その子孫であるすべての葉の名前のリストを取得する方法は何だろうと思っています。

たとえば、私はこれを作成しますdendrogram:

を使用してプロットするdendextend

深さのカットオフを 14.5 に定義すると、次のようになります。

ここに画像の説明を入力

私のリストは次のとおりです。

0 投票する
2 に答える
408 参照

r - 公差のカットオフを指定してデンドログラムを折りたたむ

dendrogram特定の許容範囲のカットオフのブランチを折りたたみたいと思います。

私は次dendextendcollapse_branch に従っています。

ここに画像の説明を入力

とは異なり、dendrogram折りたたまれたすべてのブランチ (つまり、垂直の赤い破線の右にあるクレード)を三角形に置き換えたいと思います。dendextend

ここに画像の説明を入力

これが多すぎる場合は、公差のカットオフで枝を切ることで解決します.