問題タブ [bioconductor]

For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.

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r - 「オリゴ」バイオコンダクタ パッケージのロード中にエラーが発生しました

Windows XP で、R 2.15.3 に更新し、すべてのライブラリを更新した後、BioConductor から "oligo" パッケージを読み込めなくなりました。

再作成するには:

次のエラーが発生します。

それが言及しているファイル「C:/Program Files/R/R-2.15.3/library/affxparser/libs/i386/affxparser.dll」は、本来あるべき場所にあります。

sessionInfo() は以下を返します:

.libPaths() は以下を返します:

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r - Gviz の注釈トラック

bioconductorパッケージを使用した経験のある人はいますか: を直接上Gvizに追加する方法を知っていますか?AnnotationTrackDataTrack

たとえば、ggplot2+ を使用して既存のプロットに追加geom_textできますが、同様の機能を見つけることができませんでしたGviz

ありがとう!

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r - プッシュ ビューポートを使用した図のオーバーラップ

次のコードを使用して、2 つの図を 1 つの PDF にプロットしようとしています。

問題は、2 つの図が重なっているということです。(そして図のrow2は空のままです)

新鮮な目が私のバグをキャッチすることを願っています。私は何を間違っていますか?

@DINREからのコメントを反映するように編集

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r - 小さなサンプルに limma ebayes を使用するには? (Rプログラミング)

テストとコントロールからの次の発現データがあり、それぞれに 2 つのサンプルが含まれています。

を使用して P 値を計算し、 ebayesを使用してそれらが微分的に表現されているかどうかを確認したいと思い ます。

標準の t.test を使用するのは簡単ですが、小さなサンプルには役に立たないことがわかりました。

それについて行く方法は何ですか?ヘルプファイルからは明らかではありません。

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r - R を使用してジオデータベースにクエリを実行し、バイオコンダクターで使用する

ジオデータベースの GSE ファイルを R にインポートしようとしていますが、バイオコンダクター ソフトウェアで分析できる形式にする方法がわかりません。その方法を教えてください。

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r - Rgraphviz: プロット領域外のエッジ ラベル

Rgraphviz2 つのエッジ ラベルを持つオブジェクトをプロットしようとしています。残念ながら、ラベルはプロットの外にあります。これが私の例です:

これが私のプロットです:

私はいくつかのことを試しましたが、成功しませんでした:

1. バウンディングボックスを大きく設定する

2. ラベルのフォントサイズを小さくします (実際にはアプリケーションに必要なサイズではありません)。

3.par属性 を変更します。

4. ノード、エッジ、および一般属性を?Rgraphviz::GraphvizAttributes

私の試みはどれもうまくいかないようです。誰にもアイデアはありますか?