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For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.
r - 既存の rgl オブジェクトに 3D シェイプを追加します: alphashape3d
metaMDS()
「ビーガン」パッケージを使用して、種のデータセットでこの序列分析を行いました。私は複数の次元を使用しているので、これらの次元のうち 3 つを 3D プロットに表示するとよいと思いました。「ビーガン」パッケージにはいくつかの 3D 機能がありますが、結果はあまり明確ではありません。この「クモ」をこのorglspider()
関数を使用して表示できます。私はむしろ「ordihull」のようなものを持っていますが、3D グラフとしてではありません。「alphashape3d」パッケージを使用すると、これを行うことができます。必要に応じて 3D シェイプを正確に描画できます。問題は、同じフレームにこれらの形状を 3 つプロットする必要があることです。私は試した"add=T"
しかし、これは機能しません。2 番目と 3 番目の形状の呼び出し方法を変更する必要があると思いますが、これを行う方法がわかりません。これまでに試したことの例を次に示します。
r - rでのdata.frame変換
たくさんの列を持つ df があります。各行は、各サンプリング旅行で見られる種を表します。これを、各列が種で、各行がサンプリング旅行であるマトリックスまたはデータフレームに変換したいと思います。ビーガン関数を使用して分析用に変換したい。私は基本的に、Rでこの溶けるdata.frameの反対が欲しい
元のフォーマット
私はそれを次のように変換したい:
if ステートメントを使用して恐ろしい二重の for ループを作成しないようにしていますが、それが私がしなければならないことである場合...
r - ビーガンを使用した cca : 制約のない慣性なし
ビーガンを使用して、7500 サイト、9 種、および 5 つの制約変数を使用して CCA 分析を実行します。結果は >
制約のない、または完全な慣性がない理由がわかりません。
r - 平均で結合し、テーブルから別のデータをプロットする
私は推定R(ビーガン)を使用して、mothurの出力からこのテーブルを生成しました。ただし、これまでのところ、テーブルからプロットする方法がわからないため、これを続行できません...
R にもう少し習熟できればと思いますが、次の 2 つのタスクを実行するのに苦労しています。
(膨大なリストで申し訳ありません)
あなたが与えることができる助けを前もってありがとう!
乾杯!アンドレ